外用治疗扁平疣的方法有很多，但是，没有特别疗效肯定的药物。因为每个人有个体差异，对药物的治疗反应也各不相同。一般推荐局部外用有角质剥脱作用或者细胞毒性作用的药物，这些药物有一定的刺激性，用药时一定要注意只点涂在疣体上。可以使用的药物，有3%-5%的雷琐辛溶液，每日外用1-2次；或者0.5%-1%的鬼臼毒素酊，每日外用2次；5%的氟尿嘧啶，还有0.025%-0.05%的维A酸软膏，每日睡前使用；3%的酞丁安软膏，每日外用2次；咪喹莫特软膏，隔日外用1次，2-4周为1个疗程。系统用药：如果在外用药效果不理想的情况下，可以用干扰素100万单位肌内注射，每周3次，连续3周。对于散在的、少发的皮疹，也可以考虑用液氮冷冻或者激光等物理疗法。