器质性和功能性疾病的区别，主要是在器质性疾病会有病理学上的实质性改变，功能性疾病在病理学上并没有改变，仅是脏器、器官的功能有异常。功能性疾病是与器质性疾病相对而言，主要是指由于大脑皮层功能失调，导致自主神经功能紊乱而产生的一系列临床症状。由于人体自主神经分布广泛，当其功能紊乱时产生的临床症状往往呈多种多样，且与器质性疾病的症状相似，易被误诊为器质性疾病，造成治疗效果不佳。器质性疾病是肉眼或显微镜下看到器官组织结构发生了病理性的改变，受累器官功能减退或丧失。病情严重，病程迁延，不易治愈；病灶逐渐扩大，严重者可导致死亡。