肾结石碎石以后还是疼痛，可能有两方面原因：1、由于结石打碎以后，随着尿路排出的过程中，会刺激到尿路的黏膜引起疼痛。对于这种情况，可以通过口服解痉、镇痛的药物，减轻疼痛的症状。另外，注意观察是否有小的结石排出体外，可以将尿液排入固定的容器中，方便观察。如果看到结石排出体外以后，要及时的复查腹部平片、彩超，看是否还存在有残石。2、结石并没有完全打碎，还残留较大的结石，也会刺激尿路黏膜，造成疼痛的症状。这种情况除了应用镇痛、解痉的药物以外，还要再次进行体外冲击波碎石，或者进一步考虑行手术碎石、取石。