生物安全柜内部消毒常采用的消毒剂是70%乙醇或含有氯的消毒剂。

70%乙醇是一种广泛使用的消毒剂，具有良好的杀菌、灭菌和消毒作用。它能够破坏细胞膜和蛋白质，从而杀死微生物。70%乙醇的优点是易于获得、价格便宜，且不会对环境造成污染。但是，它不能有效地消灭芽孢和病毒等耐久性微生物。

含有氯的消毒剂常用于消毒高风险区域，如生物安全柜内部。氯化物（如次氯酸钠）能够破坏微生物的细胞壁和膜，从而杀死细菌、病毒和真菌等微生物。含有氯的消毒剂具有广谱杀菌作用，能够有效地消灭耐久性微生物。但是，含有氯的消毒剂也有缺点，如易挥发、刺激性强、腐蚀性强等。因此，在使用含有氯的消毒剂时，需要注意安全操作，避免对人体和环境造成危害。