腋窝部位定植了多种细菌，如，棒状杆菌、葡萄球菌、微球菌、丙酸杆菌等。棒状杆菌最为主要，腋窝大汗腺分泌物在棒状杆菌作用下，分解产生挥发性的不饱和脂肪酸腋、硫醇、类固醇物质等多种小分子物质，其中E-3M2H不饱和脂肪酸主要产生腋臭的刺激性味道，汗液中存在少量的硫化的类固醇或脂肪酸，具有更强的刺激性，葡萄球菌可产生微弱酸味，加重腋臭异味。