生殖器疱疹病毒感染主要引起生殖器疱疹，在治疗上选用抗疱疹病毒的药物治疗，比如内服阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦、更昔洛韦，或者局部外用阿昔洛韦乳膏、喷昔洛韦乳膏、干扰素凝胶等，这些都有很确切的抗疱疹病毒作用，对生殖器疱疹有效。如果局部已经有破损、糜烂，继发感染，还应该加用抗菌药膏治疗，比如百多邦、夫西地酸乳膏等。生殖器疱疹比较容易复发，与机体的免疫功能有密切关系，所以对于反复发作的生殖器疱疹，可以加用能够增强机体免疫力的药物，包括胸腺肽、转移因子等，可能有一定帮助。另外在生活方面要注意适当加强锻炼，保持良好的作息，避免劳累、熬夜等，都能够提高机体免疫力，降低生殖器疱疹的复发频率。