女性生殖系统霉菌感染的患者，可以用于治疗的药物种类繁多。比如，阴道内局部使用的克霉唑阴道片、硝呋太尔制霉菌素栓、氟康唑胶囊、双唑泰栓等。又比如，口服的氟康唑片、伊曲康唑片、硝呋太尔片等药物。如果患者是还没有结婚、也从来没有发生过性行为的女性，就适合口服抗真菌的药物进行治疗。如果患者是已经有过性行为的女性，就适合在阴道内放药来进行治疗。不论采取哪一种方法给药，霉菌性阴道炎的患者都需要坚持用药较长一段时间，否则容易反复复发。对于有性生活史的女性来说，如果性伴侣有症状，也要同时进行治疗。