慢性咽炎的原因非常复杂，可能和周围环境、细菌、病毒感染、职业因素以及咽喉反流性疾病有一定关系。慢性咽炎在临床中比较常见，一部分患者是因为急性咽炎反复发作而转变为慢性咽炎。另一些患者经常患有上呼吸道感染症状，例如慢性鼻炎、鼻窦炎、鼻咽部疾病或者是慢性扁桃体炎、龋齿等，都有可能会引起慢性咽炎。一些患者有胃食管反流疾病，长期刺激咽部，也会引起慢性咽炎。患者患有慢性疾病，例如贫血、消化不良、心脑血管系统疾病或者肝肾等疾病也可以引发此病。除此以外，患者不良的习惯，例如长期吸烟、饮酒、长期在粉尘灰尘的环境下，或者一些患者的职业因素，例如教师、歌唱者等，都可能会引起慢性咽炎的发生。