脑囊虫病的治疗分为三个部分，一般包括生活方式调整、药物治疗以及手术治疗这三部分。在生活方式调整方面，建议患者避免生食、半熟食习惯，以免再次接触病原。在药物治疗方面，一般以驱虫药物治疗为主，常见的有比喹酮、阿苯达唑等广谱抗蠕虫药物。在手术治疗方面，一般选择不耐受抗蠕虫药物人群，或者常规治疗效果较差人群。手术方式常见于颞肌下减压术、脑室-腹腔分流术、脑囊虫摘除术等。