支原体阳性，早期使用适当的抗菌药物，可以迅速的缓解病程，这种疾病也会有一定的自限性，但大多数的病例不能够不经治疗就可以自愈的。大环内酯类抗菌药物是支原体感染的首选药物，例如红霉素、罗红霉素和阿奇霉素，氟喹诺酮类如左氧氟沙星、加替米星和莫西沙星，四环类也用于肺炎支原体、肺炎的治疗，治疗量程一般2到3周，因为肺炎支原体没有细胞壁，青霉素或头孢菌素类等抗菌药物，是没有效果的，对于剧烈呛咳者应适当给予镇咳药，如果继发细菌感染，可以根据痰病原学检查进行针对性的抗菌治疗。