肛瘘手术后疼痛，可以通过坐浴、涂抹药膏、口服止痛药物治疗。肛瘘做了手术后，由于伤口还没有愈合，出现疼痛也是比较正常的现象。可以用高锰酸钾局部坐浴，促进肛周的血液循环，缓解肛门括约肌痉挛，起到消毒清洁创面，避免污染物刺激伤口引起的疼痛。切口表面可以涂抹痔疮膏，因为痔疮膏有冰片和麝香能起到消肿止痛的作用。疼痛比较明显的，可以给予布洛芬缓释胶囊，外涂利卡多因凝胶减轻疼痛。