长期服用避孕药的情况下，可能会带来的危害和服用避孕药的类型有关。长期服用紧急避孕药避孕的女性，最主要的不良危害月经失调。主要是因为大剂量的孕激素，对下丘脑-垂体-卵巢轴的分泌功能产生了抑制作用，使卵巢分泌性激素的功能减弱，导致了月经紊乱的现象。同时也可能影响到血脂代谢以及肝功能。长期服用短效避孕药避孕的女性，最主要的不良影响是月经血量可能会逐渐的减少，对于血脂代谢以及肝功能影响比较明显，也有可能会增加血栓性疾病的发病率。