引起小孩子头疼的原因，可分为颅内病变和颅外病变。颅内病变最常见的是中枢神经系统的感染性病变，像各种脑炎、脑膜炎、脑脓肿、中毒性脑病；脑血管病像脑出血、脑梗塞、偏头痛等；颅内的占位性病变，如各种脑肿瘤；以及脑外伤后头疼；有一部分孩子有良性颅内压增高或降低也会引起头疼。颅外因素有全身性的疾病，像急性感染性疾病，特别是伴有发烧的时候；一些慢性全身性疾病，像糖尿病酮症酸中毒、尿毒症、神经官能症也会引起头疼；高血压也会引起头疼；还有一氧化碳中毒等。局部的因素，如眼压高也会引起头疼；还有鼻炎、鼻窦炎等也会引起头疼。