肛瘘手术后疤痕疼痛，可以采取药物治疗或者手术治疗。肛瘘需要手术治疗，可以采取肛瘘切除术、肛瘘切开引流术等，手术后创面形成疤痕，排便时刺激手术区域可出现疼痛症状。如果患者症状较轻，可以采取药物保守治疗，口服非甾体抗炎药，在肛管内塞入痔疮栓，同时进行扩肛治疗，改善肛门疼痛症状。如果患者病情特别严重，保守治疗效果不好或者出现肛门狭窄，此时可以考虑再次手术，将局部疤痕组织切除，从而改善患者临床症状。