尖锐湿疣病毒一般是由传染所致，尖锐湿疣的病毒可以通过直接的性接触，也可以通过被患者所污染的物品进行传播。90%的尖锐湿疣是由低危型的人类乳头瘤病毒所引起，主要是6型和11型。也有30%多的尖锐湿疣的皮损中，存在高危型的人类乳头瘤病毒，例如16型、18型、52型、56型，其中16型、18型与宫颈细胞的异常增生有关。尖锐湿疣病毒其实就是人类乳头瘤病毒，人类乳头瘤病毒是有多种分型的。人类乳头瘤病毒不仅能够引起尖锐湿疣，还能够引起一些其他的疣，比如寻常疣、跖疣、扁平疣、丝状疣等。人类乳头瘤病毒有很多种分型，不同的分型导致了不同疣类的出现。目前认为人类乳头瘤病毒已经有100多种亚型，其中有40多种可以感染肛门生殖器的区域。部分人类乳头瘤病毒与癌症风险相关，比如宫颈癌，称为高危型的人类乳头瘤病毒。