硝呋太尔胶囊主要是用于治疗细菌性阴道疾病、滴虫性阴道炎、念珠菌性阴道炎以及外阴炎。也用于治疗泌尿系统的感染，用于治疗消化道阿米巴病以及贾第虫病的。通常情况下阴道感染，每次两粒，每天三次，要连续口服七天，饭后服用，建议夫妻同时服用。也用于治疗泌尿系统的感染，成人6到12粒每天，平均连续服用一到两周。儿童10到20毫克每千克每天，要分两次进行口服。用于治疗消道阿米巴病，成人每次四粒，每天三次，连续口服十天。