如果肛瘘手术后出现疼痛，应当及时查看创面。常见的原因可能是创面继发感染形成脓肿引起疼痛，出现这种情况应当扩大创面、通畅引流，将脓液彻底清除，积极的给予中药坐浴或熏洗改善肛周的微循环，减轻疼痛的症状。常用的中药有五倍子汤、苦参汤或止痛如神汤，药物加水煮沸，先熏后洗。如果创面没有出现感染的情况，术后疼痛的原因可能是粪便刺激创面而导致。平时应当保持排大便通畅，避免出现粪便干结，多饮水，多吃一些蜂蜜。还可以喝一些蜂蜜水或液状石蜡油，促进粪便的顺利排出，减轻粪便对手术后创面的刺激，防止出现疼痛、出血的情况。以上方案仅供参考，具体药品使用请结合自身情况在专业医生指导下用药。