对于巧克力囊肿的女性在囊肿比较小的情况下应该考虑服用孕三烯酮，达那唑，米非司酮片等药物来进行保守治疗，同时还可能需要考虑肌注亮丙瑞林或者是曲谱瑞林来进行治疗。但对于巧克力囊肿比较大的女性其药物保守治疗效果通常不是特别良好，往往都可能需要专门进行手术治疗。在巧克力囊肿没有破裂的情况下可以行腹腔镜微创手术将囊肿切除。而对于巧克力囊肿已经破裂的女性则需要考虑行开腹手术进行抢救治疗。同时巧克力囊肿的女性可能没办法通过吃特殊的食物来进行治疗。以上方案仅供参考，具体药品使用请结合自身情况在专业医生指导下用药。