乙肝病毒小三阳的患者首先要确定是否需要抗病毒治疗，然后再考虑选择什么药物抗病毒。小三阳的患者只要HBV-DNA阳性，同时伴有明显的肝脏炎症或纤维化，都需要抗病毒治疗；另一种情况是HBV-DNA阴性，但是伴有失代偿期肝硬化也要抗病毒治疗。抗病毒药有两类，一类是核苷类和核苷酸类抗病毒药，国内外指南推荐应用的有三种药，分别是恩替卡韦、富马酸替诺福韦二吡呋酯、富马酸丙酚替诺福韦，这三种药的共同特点是抗病毒作用强、耐药率低、副作用小。其中富马酸替诺福韦二吡呋酯是孕妇可以口服的药物，常用作乙肝病毒的母婴阻断，个别患者长期应用会影响肾脏功能和血磷的水平，应用过程中需要监测肾功能和血磷。另一类是长效干扰素，除具有抗病毒作用外，还有抗纤维化和抗癌作用。以上两类药物必须在专科医生指导下根据病情选择应用，而且要定期复查、监测和随访。