宝宝睡醒时咳嗽，一般有以下两方面原因：首先，器官炎症。晚上睡觉痰液沉积，早上醒来时痰液活动易刺激气管，造成咳嗽情况；必要时进行抗感染治疗。其次，过敏因素。孩子早上醒来时，空气中有大量尘螨，刺激孩子器官造成咳嗽，必要时采取抗过敏治疗。