泡性结膜炎一般认为是结膜、角膜组织对内源性微生物蛋白质变态反应引起的局部病变，局部治疗一般可以使用0.1%的利福平眼药水或0.5%的链霉素和0.05%的地塞米松眼药水交替点眼治疗，晚上可以加用糖皮质激素。另外可以口服维生素b12、鱼肝油和钙剂等，另外可以去除慢性的病灶，积极治疗原发病，平时注意锻炼身体，增强体质，加强营养和个人卫生。另外对于顽固复发性，患者可以使用0.1%的环孢素和抗生素药水联合滴眼治疗。