指甲长在肉里面去了可以采取局部用药的方式保守治疗，如果比较严重的情况下，则需要选择手术的方式治疗。指甲长在肉里面，如果局部出现了轻微的疼痛或者肿胀的症状，可以采取消炎的药膏涂抹，并且需要对指甲部位采取修剪。出现了比较严重的情况，比如出现了化脓性病变，则需要对局部切开引流，并且通过抗感染的药物使用，还需要采取病甲的去除。在指甲长到肉里面以后需要做好局部的护理工作，如果出现了感染，要避免过早的沾水，以免加重病情。