患者肛门位置长了痘痘，可能是以下几种原因导致的：第一种原因，可能是肛门周围出现了脓肿，这种情况是由于肛腺感染之后，向肛部周围进行蔓延，导致出现了质地比较硬的肿物。第二种原因，如果病人肛门部位，受到真菌感染之后，就会出现肛部周围湿疹，通常在肛部的周围，能看到一些比较硬的小丘疹，还会伴随黏液的渗出。第三种原因，患者肛门部位长痘痘也有可能是出现了尖锐湿疣，这种是病毒性的传播，大多数情况都是由于不洁的性生活导致，如果出现这种情况，需要及时的进行诊断、治疗。除了以上这三种原因之外，肛门上长痘痘也有可能是由于出现了皮脂腺囊肿或恶性肿瘤。