有了灰指甲，可以局部治疗，也可以内服药物治疗。目前临床上用的比较多的，就是内服药物的治疗。因为甲真菌病，外用治疗效果欠佳，所以现在提倡口服药物。常用的有伊曲康唑，盐酸特比萘芬。口服这些药物以后，药物可以通过血液到达甲根部和甲床，然后再进入甲板，可以抑制甲组织中的真菌的生长。随着新甲不断的生长，最终就可以替代病甲。对于伊曲康唑，可以采取冲击疗法，也可以采取连续用药的方法，盐酸特比萘芬一般就是连续用药，连服6到12周。但是这种内服药物，要注意监测患者的肝功能，如果患者有肝功能不良，那么暂缓服用，或者是外用药物治疗。在治疗过程中，也需要定期的监测患者的肝功能。对于外用药物的治疗，现在比较好的药物有5%的阿莫洛芬。