阿莫西林胶囊的副作用主要有以下几点：一、过敏反应症状。患者可出现药物热、荨麻疹、皮疹和哮喘等，尤其容易发生于传染性单核细胞增多症患者。二、消化系统的症状。患者会有恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状，少数患者可能会有假膜性结肠炎。三、血液系统症状。少数患者会有嗜酸性粒细胞增多、白细胞减少、血小板减少、贫血等症状。四、肝肾功能紊乱。少数患者用药后可能会出现转氨酶增高以及急性间质性的肾炎。五、其他副作用。包括兴奋、焦虑、失眠、头晕等中枢神经系统的症状，长期使用可能会导致真菌感染。