痔疮手术后三个月大便出血，有可能是痔疮出血或者肛裂出血，也有可能是肠道里面的出血。如果是出血鲜红色的，有可能是痔疮又复发了，或者是有肛裂的出血导致的。而如果是有暗红色的血，有可能是直肠或者结肠里面出血。如果想明确诊断的话，最好的办法是到医院就诊，让医生检查一下，看看是否有肛门疾病导致的出血，比如痔疮，肛裂等等。如果肛门没有发现出血的迹象，那么有可能是直肠或者结肠里面出血引起的。这样的话，还需要进一步做肠镜检查来明确评估一下肠道里面的情况，观察是否有一些病变，比如肿瘤、肠炎、息肉等等。如果有的话，还需要进一步的治疗。