衣原体是一种不同于细菌，也不同于病毒的一种微生物，属于原核生物，即细胞没有形成核膜的细胞核。而衣原体是唯一的具有两阶段繁殖周期的严格的细胞内寄生的原核生物，分为代谢不活跃的细胞外期和增值性的细胞内期两个阶段。依照其抗原性质、形态以及所含有糖原的不同，依次分为沙眼衣原体、肺炎衣原体等。衣原体的致病机理是抑制被感染细胞代谢，溶解破坏细胞，并导致溶解酶释放，代谢产物的细胞毒作用，引起变态反应和自身的免疫反应。衣原体感染可引起子宫感染、早产，有可能出现流产、尿道感染、肺炎、支气管炎，以及胃肠炎、脑脊髓膜炎、结膜炎以及关节炎等多种疾病。而衣原体阴性则是没有这些细菌病毒的持续感染。