脑囊虫病的治疗主要采用药物治疗和手术治疗的方式进行，药物治疗适合病情比较轻微的患者，一般使用吡喹酮、丙硫咪唑、甲苯咪唑等药物，但是这些药物的副作用比较明显，因此在服药期间，医生和患者要关注药物的副作用。如果脑实质内多发性囊虫病的数量太多，而不能够完全清除，这时会引起广泛的脑水肿、颅内压升高，危及生命或者影响视力，并且使用药物治疗副作用非常明显，颅内压更加增高，因此需要使用手术进行治疗。