慢性结肠炎可以选择西药和中药进行治疗，西药可选择伊曲康唑、肠炎宁颗粒、布拉氏酵母菌、硫酸阿托品等联合用药治疗。肠道内感染致病菌是引起慢性肠炎的一个较为主要的原因，伊曲康唑是属于广谱抗生素，可以抗病原体治疗。肠炎宁颗粒可以止泻，减少大便次数。布拉氏酵母菌能够调节肠道内环境，提高肠道的免疫力，促进疾病恢复。硫酸阿托品是属于抗胆碱类型的药物，能够缓解肠道痉挛和腹部疼痛。如果服用中药治疗，可以选择参苓白术丸、肠炎宁片。