急性肠胃炎患者如果没有畏寒、发热、外周血白细胞没有明显增加，可以不用抗菌药物。有发热、白细胞增高等炎症反应综合征表现，可以适当使用抗菌药物，首选口服给药，必要时也可考虑静脉给药。喹诺酮类抗菌药物为首选，如左氧氟沙星、利福昔明等，也可口服庆大霉素、黄连素等。中药葛根芩连汤、三黄解毒汤等也有抗菌功效，急性肠胃炎常为自限性，对症治疗也很关键，腹痛明显可给予解痉止痛，常用的解痉药有抗胆碱能药物，如山莨菪碱、颠茄片等。但这类药物不具有受体选择性，不良反应较多，如口干、腹胀、心动过速、眼压增高等。