肩胛骨缝疼的原因主要有：1、慢性劳损。长时间的低头或肩部长期负重，过度后伸等，会使肌肉、筋膜紧张劳损，从而引起肩胛骨缝疼痛。2、受凉受寒 。受寒会使局部肌肉脉络拘挛而引起疼痛。3、外伤，外伤也可以引起局部软组织损伤或骨骼损伤而疼痛。4、颈椎疾病引起的。颈椎病特别是神经根型的，神经受压迫后其支配区域会出现疼痛。