两个月婴儿消化不良主要是因为婴儿胃肠道发育还不完善，此时可以观察婴儿大便次数以及大便性状是否正常，如果大便正常，而且吃喝或者尿量、精神状态都是好的，不需要进行治疗。如果出现大便秘结或者腹泻等症状，可以口服益生菌，能够起到缓解症状的作用。