小便时候尿道有刺痛这最大的可能性就是有泌尿道感染。化验尿常规就会发现尿中有红细胞、白细胞等，也可能在尿道口有脓液流出。建议一定要多喝水、多排尿，促进炎症的排泄。最常见的可能就是吃广谱抗菌素，一般推荐左氧氟沙星、头孢地尼等。一般吃药2~3天疼痛就会明显缓解，3~5天有可能达到彻底治愈。同时也可以吃碳酸氢钠，它可以碱化尿液，缓解排尿刺痛的症状。一些中成药也可以吃，比如热淋清、癃清片等。推荐每天的喝水量大于2500毫升，要注意局部的个人卫生。