清洗摩托车发动机内部零件方法如下：

1、大修时全部解体后清洁；

2、使用质量可靠的清洗产品，启动汽车结合清洗剂产品一起清洗。此类方式的弊端是：积碳严重的汽车很容易堵塞发动机内部小油道，增加了发动机的磨损和老化；

3、使用质量可靠的产品，并使用专门清洗发动机的全电脑控制设备，结合清洗剂一起对发动机进行清洗（一般在高档品牌汽车4S店都拥有）。