两个月吃三次紧急避孕药对机体究竟有什么影响需要因人而异，通常紧急避孕药是偶尔采取的紧急避孕措施，而非常规性使用。多次服用紧急避孕药可能会对机体造成不利的影响，特别是对月经，可能会造成月经不调、闭经等。如果长期没有保护性的性生活，可以服用短效避孕药，因为短效避孕药对机体的影响会更小，如果已经生育过，需要采取长期的避孕措施，可以选用上宫内节育器或者是体内埋线，最好减少服用紧急避孕药的次数，以免对机体带来不利的影响。