最好在饭后20分钟服用益生菌，因为这段时间胃酸浓度在下降。这对人体胃内活菌的顺利到达非常有利，也会使益生菌在人体内发挥最大的作用。当食物吃进胃里时，会消耗人体大部分胃酸，这对益生菌更好地流入小肠非常有利。否则，即使其中一些肯定流入小肠，也会受到一定程度的损害，使益生菌的功效大打折扣，达不到最佳效果。另外，要注意服用益生菌时用温水送服，不要同时用开水，否则高温会杀死很多益生菌，造成很多功效的丧失。因此，饭后二十分钟服用益生菌是最佳时间。