当出现十二指肠炎症和胃炎时，需要使用药物进行治疗，此时最先使用的药物就是抑制胃酸分泌的药物，抑制胃酸的分泌能够减轻胃粘膜的炎症反应，同时也可以减轻十二指肠球部粘膜的炎症，最常使用的就是质子泵抑制剂，例如奥美拉唑或雷贝拉唑，能够特异性的和胃的壁细胞膜上质子泵ATP酶结合，抑制该酶的活性，从而达到抑制胃酸分泌的目的；也可以使用H2受体拮抗，抑制胃酸的分泌。另外可以和胃肠粘膜保护剂来联合使用的，例如胶体果胶铋、硫糖铝片，在胃肠黏膜表面形成保护层，能够避免各种不利因素的刺激，促进胃肠粘膜的恢复。