治疗膀胱炎的药物主要是抗生素。由于能引起膀胱炎的细菌多是革兰阴性杆菌，比如大肠埃希菌，所以选用抗生素时，一般选用广谱的抗生素和对革兰阴性杆菌比较敏感的抗生素。前者比较常用的有青霉素类的，头孢类的和磺胺类的抗生素，比如阿莫西林，头孢哌酮以及复方新诺明。而后者比较常用的有喹诺酮类的抗生素，比如左氧氟沙星。除此之外，为了缓解病人的尿频，尿急，尿痛等膀胱刺激症状，可以同时应用碳酸氢钠治疗。