长期吃恩替卡伟的患者可能会出现以下副作用：一、出现疲劳、头痛、恶心、皮疹等现象，一般程度都比较轻，不影响生活；二、出现睡眠障碍，有的人服用之后会难以入睡或者睡眠变浅、睡眠时间缩短、容易早醒、睡眠质量较前有明显下降，停药之后基本都能恢复正常；三、有可能出现乳酸酸中毒，比较常见于失代偿期肝硬化的患者；四、部分患者可能会出现肾功能异常，表现为肌酐上升，出现尿微量白蛋白、肾小球滤过率下降的表现。但是总体而言恩替卡韦的副作用非常轻和非常少见，还是临床上很好用的一线抗病毒药物。