慢性腹泻可以吃一些调节肠道菌群的药物，以及口服一些止泻的药物进行治疗，但是还是要具体的查明导致慢性腹泻的病因是什么，可以完善电子肠镜的检查，腹部影像学检查，比如CT，彩超，核磁共振等等，明确疾病的原因，根据不同的病因，采取相应的治疗措施。比如，如果是因为慢性胰腺炎所导致的慢性腹泻，就需要积极地补充胰酶，助消化治疗。如果是因为慢性的阿米巴疾病所导致的慢性腹泻，就要积极地抗阿米巴病治疗。