更年期全身骨头都在痛，有可能是因为缺钙引起的，所以在更年期除了注意补钙以外，要加强运动，促进钙的吸收，必要时可以配合中成药进行调理，缓解更年期的症状。因为在更年期卵巢功能下降，雌激素水平低，就会导致钙代谢出现障碍，就会伴有骨质疏松。而且在疼痛严重的情况下，也要到内分泌科就诊，确定是否出现了风湿免疫方面的疾病。