一支咳嗽临床上常见于很多原因，最常见的还是呼吸系统的疾病为主，主要是呼吸系统的炎症反应受到了病原体的入侵而引起了支气管炎肺炎甚至肺脓肿。比如这些肺部感染的因素包括支原体衣原体立克次体结核分枝杆菌真菌钩端螺旋体以及其他的原虫，传染性的寄生虫等。另外也见于气道高反应状态，主要是气道内出现了充血水肿和大量炎性物质渗出，伴随有支气管平滑肌的收缩和痉挛，常见于咳嗽变异性哮喘。另外也见于嗜酸性粒细胞性肺炎等心血管系统的疾病，比如各种原因引起的左心功能衰竭而引起的肺淤血，甚至肺水肿，包括有二尖瓣的狭窄以及支气管结核，还有肺含铁血黄素沉着症等，都可以引起长时间的咳嗽。