4cm胃间质瘤不能确定是良性还是恶性，间质瘤的大小不能对肿瘤的性质进行判断。对于胃间质瘤性质的判断最终要进行病理学的检查，首先要对患者进行胃镜或影像学的检查，明确胃间质瘤发生的部位，也可以对胃间质瘤的性质进行初步的判断。可以通过胃镜取得胃间质瘤的病变组织，然后对病变组织进行病理学的检查，可以确定间质瘤是良性还是恶性。