南京简称“宁”的由来有两种说法：

一种说法是因为南京地理位置处于江苏省中部，古时候称为“宁国”，后来演变成了宁。这个说法比较流行，也比较有说服力。

另一种说法是因为南京历史上曾经是中国的首都，统治者希望南京成为一个“安宁”的城市，因此将其简称为“宁”。

总的来说，南京简称“宁”的原因可能是由于历史和地理等多种因素的影响。