碘酊直接消毒的危害主要是由于刺激性产生的。因为碘酊的腐蚀性比较强，如果伤口有溃烂，患者粘膜比较薄的时候，比如眼睛、口腔或者是会阴部，应用碘酊进行消毒，有可能会产生局部的刺激反应出现疼痛，而且不利于伤口的恢复，此时往往需要用酒精进行脱碘。而且临床上一般选用碘伏进行消毒，它刺激性比较小，有利于伤口的愈合。