当子宫内膜和腺体异位到子宫体以外的部位时称为子宫内膜异位症。子宫内膜异位症最主要的症状是疼痛，典型的症状表现为继发性痛经，进行性加重，疼痛位于下腹、腰骶及盆腔中部，有时候可以放射至会阴部、肛门及大腿，常于月经来潮时出现，并持续至整个经期。疼痛严重程度与病灶大小不一定成正比，粘连严重的卵巢异位囊肿患者可能并无疼痛，而盆腔内小的散在病灶却可引起难以忍受的疼痛；少数患者可以表现为持续性下腹痛，经期加剧；但有27%到40%的患者没有痛经，因此痛经不是子宫内膜异位症诊断的必需症状。