蜡样芽孢杆菌活菌片主要用于婴幼儿腹泻、慢性腹泻、肠功能紊乱以及肠炎的治疗。该药物属于调节肠道菌群的药物，在用药过程当中一般不会产生明显的不良反应，也没有确切的禁忌症，常用量一般是一天三次、一次两片。儿童需要减半服用，婴幼儿服药时可以加入少量的温开水或者奶液溶解以后再服用。该药物服用以后蜡样芽孢杆菌进入肠道会消耗肠道内过多的氧气、创造厌氧环境、促进厌氧菌的生长、调整肠道菌群失调、改善人体的微环境，达到治疗目的。所以该药物相对来说比较安全，很少发生不良反应。一般情况下，如果发生肠道菌群失调，大部分都是跟长期的腹泻、恶心、呕吐或者使用其他的抗菌药物有很大关系，如果是应用抗菌药物导致的需要停用原先的抗菌药。