胆管内结石以手术治疗为主，可以辅以其他治疗措施。对于没有引起明显的临床症状，没有导致局部胆管扩张的肝内胆管结石，可以暂时先观察。在临床观察期间需要对饮食进行控制，不能摄入高脂肪含量的食物，以免诱发胆绞痛。因胆管内结石导致胆管发炎，出现轻微疼痛症状的情况下，可以先使用抗感染的药物以及解痉止痛的药物进行治疗。反复引起胆管发炎的胆管内结石，通常都以手术为首选的治疗措施。可以根据结石的数量以及分布情况，可以进行胆管切开取石手术或者是部分肝叶切除手术。