从形态学来讲，前列腺是由腺组织和平滑肌构成的实质性器官，可分为五叶，主要有前叶、中叶、后叶和两侧叶，虽然有一叶治好，但可能其他叶还没有治好，因此是前列腺炎治不好的部分原因。从病因学角度来讲，前列腺炎的致病因素有很多，病原体有大肠埃希菌、葡萄球菌、肺炎克雷白菌、变形杆菌等，前列腺内尿液反流、前列腺结石等可能是病原体持续存在和感染复发的重要原因。从分子学角度来讲，前列腺腺上皮的类脂质膜是多种抗生素进入腺泡的屏障，这也是前列腺炎治疗不理想、难以根治的原因。