子宫内膜异位症的临床表现因人和病变部位的不同而多种多样，症状特征与月经周期密切相关，部分患者可能没有任何症状。内异症患者主要的临床症状有以下几个方面，第一，下腹痛和痛经。疼痛是内异症的主要症状，典型症状为继发性痛经，进行性加重。疼痛多位于下腹、腰底及盆腔中部，有时可放射至会阴部，肛门及大腿，常于月经来潮时出现，并持续整个经期。疼痛的严重程度与病灶大小不一定成正比，少数患者可表现为持续性下腹痛，经期加重。第二，不孕，内异症患者不孕率高达40%，主要是盆腔微环境的改变，以及内异症导致卵巢输卵管周围粘连，影响受精卵的运输。第三，性交不适，多见于直肠子宫陷凹有异位病灶，或因局部粘连使子宫后倾固定者，一般表现为深部性交痛月经来潮前性交痛最明显。第四，月经异常，部分患者可有经量增多，经期延长或者月经淋漓不尽等症状。可能是内异症导致的卵巢实质病变，黄体功能不足，或者卵巢无排卵有关。